成检测资源不能有效利用。拿工商部门来说，工商部门食品安全监测的法定资质未确定，食品质量检测是工商行政管理机关从未有过的职能。目前工商部门的检测结果既无权威性也无合法性。由于检测结果没有法律效力，工商部门在执法过程中，只能采取临时控制措施，先封存不合格的食品，再将不合格的食品样品送至有合法资质的检测机构申请复检。这就出现两个问题：一个问题是食品是特殊的商品，涉及保鲜、保质期问题，特别是保鲜食品，极易出现腐烂的情况，而封存的食品存放点往往不具备恒温环境；另一个问题是出现初检结果不合格，而复检结果合格的情况，对腐烂损耗的食品进行行政赔偿的问题难以得到有效解决。
五、农村食品安全常识不普及。老百姓形成的饮食习惯和饮食观念与食品安全要求相去甚远，尤其是在农村，刚刚解决温饱问题的老百姓还没有形成食品安全意识，也无从了解食品安全知识，更谈不上重视食品安全问题。不法商贩利用人们食品安全意识的淡薄、食品安全知识的贫乏，大肆倾销假冒伪劣食品，频频制造食品安全事故。监管部门缺乏系统的传播食品安全知识措施，没有形成抵御假冒伪劣的防护网。
六、农村信息化建设相当落后。农村食品安全的信息网络还很不完善，多数地区信息滞后，制约了食品安全监管工作的效率。食品安全的信息相对闭塞，多个职能部门之间缺乏有效的沟通。各部门对自己管辖领域内的食品安全信息一般都具有相应的采集、上报、分析、公布等机制，但部门之间缺乏必要的沟通，导致信息交流相对闭塞，资源无法共享得不到充分的利用。
七、经营者自律和社会监督不到位。面对当前农村食品市场量大面广的实际，必须加强与有关部门的密切协调配合，形成执法合力，充分发挥各级行业协会自律、经营者自律和社会监督的作用，才能有效维护食品市场经营秩序和食品安全。从掌握情况看，这方面的工作做的还不够，经营者自律机制，社会监督机制不够完善，发挥作用不明显，特别是广大农民群众维权意识、参与意识淡薄，社会氛围还不浓厚。
八、食品安全信用体系尚未建立。农村食品安全信用体系建设相对滞后，对失信行为缺少有效的防范和惩戒机制，违规失信已成为一个带有普遍性的社会问题。一些食品生产经营企业及负责人缺乏食品安全意识，片面追求企业利润，忽视食品安全质量，一些企业诚信意识不强，参与食品安全信用体系建设积极性不高，向社会作出的质量承诺难以兑现，食品消费安全环境不容乐观。
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